生体構造化学研究室

▶ 2024 - 研究成果 Activities

発表論文 Publications

  1. Koya Sakuma, Naohiro Kobayashi, Toshihiko Sugiki, Toshio Nagashima, Toshimichi Fujiwara, Kano Suzuki, Naoya Kobayashi, Takeshi Murata, Takahiro Kosugi, Rie Tatsumi-Koga, and *Nobuyasu Koga
    "Design of complicated all-α protein structures"
    Nat. Struc. Mol. Biol., 31, 275-282 (2024).
  2. Norie Hamaguchi-Suzuki, Naruhiko Adachi, Toshio Moriya, Satoshi Yasuda, Masato Kawasaki, Kano Suzuki, Satoshi Ogasawara, Naohiko Anzai, Toshiya Senda, and *Takeshi Murata
    "Cryo-EM structure of P-glycoprotein bound to triple elacridar inhibitor molecules"
    Biochem. Biophys. Res. Commun., 709, 149855 (2024).
  3. Muhammad Fathul Ihsan, *Daisuke Kawashima , Songshi Li, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata and Masahiro Takei
    "Non-invasive hERG channel screening based on electrical impedance tomography and extracellular voltage activation (EIT–EVA)"
    Lab Chip., 24, 3183-3190 (2024)
  4. Takayuki Hoshii, Sota Kikuchi, Tomoya Kujirai, Takeshi Masuda, Tomoko Ito, Satoshi Yasuda, Makoto Matsumoto, Bahityar Rahmutulla, Masaki Fukuyo, Takeshi Murata, Hitoshi Kurumizaka, and Atsushi Kaneda
    "BOD1L mediates chromatin binding and non-canonical function of H3K4 methyltransferase SETD1A"
    Nucleic Acids Research, gkae605, (2024)
  5. Tomohiko Hayashi, Masato Kawamura, Shunsuke Miyamoto, Satoshi Yasuda, Takeshi Murata, and Masahiro Kinoshita
    "An accurate and rapid method for calculating hydration free energies of solutes including small organic molecules, peptides, and proteins"
    Journal of Molecular Liquids, 406, 124989 (2024)
  6. Yasuomi Miyashita, Toshio Moriya, Takafumi Kato, Masato Kawasaki, Satoshi Yasuda, Naruhiko Adachi, Kano Suzuki, Satoshi Ogasawara, Tetsuichiro Saito, Toshiya Senda, and Takeshi Murata
    "Improved higher resolution cryo-EM structures reveal the binding modes of hERG channel inhibitors"
    Structure, 32, 1926-1935.e3(2024)
  7. Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Minoru Kato, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata, and Masahiro Kinoshita
    "Statistical-Mechanics Analyses on Thermodynamics of Protein Folding Constructed by Privalov and Co-Workers"
    J Phys Chem B, 128, 10110-10125(2024)
  8. Kano Suzuki, Yoshiyuki Goto, Akihiro Otomo, Kouki Shimizu, Shohei Abe, Katsuhiko Moriyama, Satoshi Yasuda, Yusuke Hashimoto, Jun Kurushima, Sho Mikuriya, Fabiana L Imai, Naruhiko Adachi, Masato Kawasaki, Yumi Sato, Satoshi Ogasawara, So Iwata, Toshiya Senda, Mitsunori Ikeguchi, Haruyoshi Tomita, Ryota Iino, Toshio Moriya, and Takeshi Murata
    "Na+-V-ATPase inhibitor curbs VRE growth and unveils Na+ pathway structure"
    Nat Struct Mol Biol., Online ahead of print(2024)
  9. Tomohiro Ishizuka, Kano Suzuki, Masae Konno, Keisei Shibata, Yuma Kawasaki, Hidefumi Akiyama, Takeshi Murata and Keiichi Inoue
    "Light-driven anion-pumping rhodopsin with unique cytoplasmic anion-release mechanism"
    J Biol Chem., 300, 107797(2024)
  10. Miyu Terauchi, Ryotaro Sato, Shino Homma-Takeda, Haruko Yakumaru, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata and Chiya Numako
    "Syntheses and characterization with X-ray analyses for phosphate co-precipitation of manganese and calcium"
    Advances in X-Ray Chemical Analysis Japan, 55, p. 305-315(2024)
  11. Ichie Ojiro, Hibiki Katsuyama, Ryusei Kaneko, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata, Yuko Terada and Keisuke Ito
    "Enhancement of transcription efficiency by TAR-Tat system increases the functional expression of human olfactory receptors"
    PLoS One., 19, e0306029(2024)

総説、紹介記事 Reviews


学会等における発表 Presentations

  1. 服部浩輝、星裕人、湯川博、小笠原諭、木下正弘、村田武士、安田賢司
    "理論計算に基づく一本鎖抗体の耐熱化変異体の創出"
    量子生命科学会第6回大会(ポスター発表)、早稲田大学早稲田キャンパス、2024年5月30日
  2. 宮下靖臣、小笠原諭、紺野亮、石川将己、中島大輔、小原收、斎藤哲一郎、川島祐介、村田 武士
    "hERG チャネルの立体構造解析と LC/MS/MS による精製標品の定性分析"
    第24回日本蛋白質科学会年会(ポスター発表)、札幌コンベンションセンター、2024年6月11日
  3. 濱口紀江、安達成彦、野中雄仁、金岡優衣、川崎政人、守屋俊夫、安田賢司、安⻄尚彦、千田俊哉、小笠原諭、内橋貴之、村田武士
    "高速AFMとクライオ電子顕微鏡を用いた ABCトランスポーターP糖タンパク質の相関構造解析"
    第24回日本蛋白質科学会年会(ポスター発表)、札幌コンベンションセンター、2024年6月13日
  4. 伊藤敦之、常岡姫里、陳思思、小笠原愉、村田武士
    "薬剤性肝障害の原因となるトランスポーター(BSEP)の精製系および活性測定系の構築"
    第24回日本蛋白質科学会年会 (ポスター発表), 札幌コンベンションセンター, 2024年6月13日
  5. Norie Hamaguchi, Naruhiko Adachi, Toshio Moriya, Masato Kawasaki, Satoshi Yasuda, Naohiko Anzai, Toshiya Senda, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata
    "Cryo-EM Structure of P-glycoprotein Bound by Three Elacridar P-gp-Inhibitor Molecules"
    IUPAB2024(ポスター発表)、国立京都国際会館、2024年6月25日
  6. Yasuomi Miyashita, Toshio Moriya, Masato Kawasaki, Satoshi Ogasawara, Naruhiko Adachi, Satoshi Yasuda, Tetsuichiro Saito, Toshiya Senda, Takeshi Murata
    "Cryo-EM Structure of the hERG Channel Complexed with a K+ Channel Blocker"
    IUPAB2024 (ポスター発表), 国立京都国際会館, 2024年6月26日
  7. Koki HATTORI, Yuto HOSHI, Hiroshi YUKAWA, Satoshi OGASAWARA, Masahiro KINOSHITA, Takeshi MURATA, Satoshi YASUDA
    "Elucidation of Stabilization Mechanisms of Intrabodies Based on Statistical Thermodynamics"
    CBI学会2024年大会 (ポスター発表), タワーホール船堀, 2024年10月29日
  8. 平田 桃夕, 小笠原 諭, 廣瀬 未果, 加藤 幸成, 加藤 貴之, 村田 武士, 禾 晃和
    "ナノディスクを利用した膜内切断プロテアーゼRsePが脂質二重層構造に与える影響の評価"
    第97回日本生化学会大会 (ポスター発表), パシフィコ横浜ノース, 2024年11月7日, 2P-064
  9. 山下 瑛理香, 中嶋 萌生, 岡部 勇輝, 安田 賢司, 村田 武士, 佐藤 裕介, 永野 真吾, 日野 智也
    "アンタゴニスト結合型構造解明に向けたヒト由来アデノシンA3受容体の細胞膜高発現化変異体取得の取り組み"
    第97回日本生化学会大会 (ポスター発表), パシフィコ横浜ノース, 2024年11月8日, 3P-064
  10. 戸板太陽, 鈴木花野, 石田祥一, 勝山彬, 市川聡, 大田雅照, 池口満徳, 村田武士, 寺山慧
    "分子生成AIによるV-ATPase阻害剤の最適化"
    第52回構造活性相関シンポジウム（ポスター発表）, 川崎市産業振興会館 1階ホール、4階展示場, 2024年12月12～13日, KP03

招待講演 Invited lectures


特許 Patents


プレスリリース Press releases

  1. "複雑な形状を持つタンパク質をゼロから人工設計することに成功"
    令和6年1月4日
    本学HP
  2. "Electrical Impedance Tomography-Extracellular Voltage Activation Technique Simplifies Drug Screening"
    令和6年8月1日
    本学HP
  3. "不整脈誘発薬剤との結合状態を解明 -副作用原因タンパク質hERGチャネルの構造が安全な薬設計を導く-"
    令和6年9月30日
    本学HP, PRTIMES, X（Twitter）, Facebook, Research map
  4. "千葉大学がアステラスとクロスアポイントメント協定書を締結～低分子創薬の貢献に期待～"
    令和6年11月11日
    本学HP, PRTIMES, X（Twitter）, Facebook
  5. "バンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）感染症の治療に道-ナトリウムポンプ阻害剤の発見とその阻害機構を解明-"
    令和6年11月25日
    本学HP, PRTIMES, X（Twitter）, Facebook

メディア掲載 Media Appearances

  1. "千葉大学がアステラスとクロスアポイントメント協定書を締結～低分子創薬の貢献に期待～"
    日経BP, 毎日新聞, 産経新聞, 日経COMPASS, 千葉日報

受賞 Awards

  1. Norie Hamaguchi, Naruhiko Adachi, Toshio Moriya, Masato Kawasaki, Satoshi Yasuda, Naohiko Anzai, Toshiya Senda, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata
    "Cryo-EM Structure of P-glycoprotein Bound by Three Elacridar P-gp-Inhibitor Molecules"
    IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award, 国立京都国際会館, 2024年6月25日
  2. Yasuomi Miyashita, Toshio Moriya, Masato Kawasaki, Satoshi Ogasawara, Naruhiko Adachi, Satoshi Yasuda, Tetsuichiro Saito, Toshiya Senda, Takeshi Murata
    "Cryo-EM Structure of the hERG Channel Complexed with a K+ Channel Blocker"
    IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award, 国立京都国際会館, 2024年6月25日
  3. 戸板太陽, 鈴木花野, 石田祥一, 勝山彬, 市川聡, 大田雅照, 池口満徳, 村田武士, 寺山慧
    "分子生成AIによるV-ATPase阻害剤の最適化"
    第52回構造活性相関シンポジウム 優秀発表賞 (ポスター), 川崎市産業振興会館, 2024年12月12~13日