生体構造化学研究室

▶ 2013年 - 研究成果

発表論文

  1. Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Ichiro Yamato, and *Takeshi Murata
    "Rotation mechanism of Enterococcus hirae V1-ATPase based on asymmetric crystal structures"
    Nature 493, 703-707 (2013).
  2. *Suhaila Rahman, Ichiro Yamato, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu,Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and Takeshi Murata
    "Biochemical and Biophysical Properties of Interactions between Subunits of the Peripheral Stalk Region of Human V-ATPase"
    PLoS One 8, e55704 (1-13) (2013).
  3. 西條 慎也、山登 一郎、村田 武士
    "非対称な結晶構造から明らかになったV1-ATPaseの回転機構"
    ライフサイエンス新着論文レビュー, 2013年3月12日
  4. Tomoya Hino, *So Iwata, and *Takeshi Murata
    "Generation of functional antibodies for mammalian membrane protein crystallography"
    Curr. Opin. Struct. Biol. 23, 563-568 (2013).
  5. Md. Jahangir Alam, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Yoshimi Kakinuma, Ichiro Yamato, and *Takeshi Murata
    "Loose Binding of the DF Axis with the A3B3 Complex Stimulates the Initial Activity of Enterococcus hirae V1-ATPase"
    PLoS One 8, e74291 (1-9) (2013).
  6. Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Mayu Hara, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Eiro Muneyuki, Hiroyuki Noji, *Takeshi Murata, and *Ryota Iino
    "Basic properties of rotary dynamics of the molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase"
    J. Biol Chem. 288, 32700-32707 (2013).
  7. 村田 武士
    "Essay「抗体を用いたGタンパク質共役型受容体(GPCR)のX線結晶構造解析」"
    MEDCHEM NEWS Vol. 23, No. 1, 13-16 (2013).
  8. 日野 智也、岩田 想、村田 武士
    "機能性抗体を用いたアデノシンA2A受容体の結晶構造解析"
    日本結晶学会誌 Vol. 55, No. 2, 103-109 (2013).
  9. 水谷 健二、村田 武士
    "骨粗しょう症に関与する分子モーターの回転メカニズムと創薬への取組み"
    アンチエイジングシリーズ3「骨研究最前線」, NTS, 119-122 (2013).
  10. 村田 武士、野村 紀通、小林 拓也、岩田 想
    "「膜タンパク質」の重要性とその構造が拓く未来"
    膜タンパク質構造研究, 化学同人, 1-10 (2013).
  11. 水谷 健二、山本 三沙岐、村田 武士
    "V-ATPaseの分子メカニズム"
    膜タンパク質構造研究, 化学同人, 35-43 (2013).
  12. *Md. Jahangir Alam, Ichiro Yamato, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Yoshimi Kakinuma, and Takeshi Murata
    "Mutant LV476-7AA of A-subunit of Enterococcus hirae V1-ATPase: High affinity of A3B3 complex to DF axis and low ATPase activity"
    SpringerPlus 2, 689 (1-7) (2013).

学会等における発表

  1. Hiroaki Tanabe, Satoshi Ogasawara, Kanna Motoyama, Mariko Ikeda, Madoka Nishimoto, Tomoya Hino, Takeshi Murata, Yoshihiro Nakamura, Toshiaki Hosaka, Motoaki Wakiyama, Takaho Terada, Noboru Ohsawa, Masakatsu Hato, Miki Okada-Iwabu, Masato Iwabu, Toshimasa Yamauchi, Tomomi Kimura-Someya, Mikako Shirouzu, Takashi Kadowaki, So Iwata, and Shigeyuki Yokoyama
    "Generation of anti-adiponcetin receptor 1 monoclonal antibody for structural study"
    International Conference on Structural Genomics 2013　Sapporo (Japan)　2013年7月31日
  2. Takaho Terada, Takeshi Murata, Mikako Shirouzu, and Shigeyuki Yokoyama
    "Cell-free Expression of Protein Complexes for Structural Biology"
    International Conference on Structural Genomics 2013　Sapporo (Japan)　2013年7月31日
  3. Takeshi Murata, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru, Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and Ichiro Yamato
    "Rotation mechanism of V1-ATPase based on asymmetric crystal structures"
    International Conference on Structural Genomics 2013　Sapporo (Japan)　2013年7月31日
  4. 田辺 弘明、藤井 佳史、中村 祥浩、森 慎滋、篠田 雄大、石塚-桂 芳子、新屋 直子、奥田 賢一、伊東-田嶋 夏織、堀 哲哉、池田 眞理子、脇山 素明、寺田 貴帆、大沢 登、深田 吉孝、星野 克明、改正 恒康、日野 智也、小笠原 諭、村田 武士、岩田 想、岡田-岩部 美紀、岩部 真人、山内 敏正、門脇 孝、羽藤 正勝、保坂 俊彰、木村-染谷 友美、白水 美香子、横山 茂之
    "ヒト由来膜内在性タンパク質の構造解析と創薬への展開をめざして"
    第86回日本生化学会大会 シンポジウム　横浜　2013年9月12日
  5. 松戸 翔平、西條 慎也、山本 三沙岐、柿沼 喜己、水谷 健二、村田 武士、山登 一郎
    "腸内連鎖球菌V-ATPase全体の大腸菌内発現と精製"
    第86回日本生化学会大会(ポスター発表)　横浜　2013年9月11日
  6. 鈴木 花野、水谷 健二、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、柿沼 喜己、岩田 想、横山 茂之、山登 一郎、村田 武士
    "リン酸結合型V1-ATPaseのX線結晶構造解析"
    第86回日本生化学会大会(ポスター発表・一般口頭発表)　横浜　2013年9月12日　*鈴木紘一メモリアル賞受賞
  7. 人見 健太、水谷 健二、村田 武士
    "出芽酵母を用いたセロトニン5-HT2A受容体の大量発現と精製"
    第86回日本生化学会大会(ポスター発表・一般口頭発表)　横浜　2013年9月11-12日
  8. 高椋 勇樹、末永 敦、水谷 健二、日野 智也、岩田 想、村田 武士
    "アデノシンA2A受容体の結晶構造に基づいた新規阻害剤の創出"
    第86回日本生化学会大会(ポスター発表)　横浜　2013年9月13日
  9. 齋藤 あき、齋藤 靖子、西條 慎也、山本 三沙岐、柿沼 喜己、水谷 健二、村田 武士、山登 一郎
    "Purification and Crystallization of A subunit from Enterococcus hirae V-ATPase"
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月28日
  10. 松戸 翔平、Rahman Suhaila、西條 慎也、山本 三沙岐、柿沼 喜己、水谷 健二、村田 武士、山登 一郎
    "Expression of Enterococcus hirae V-ATPase in E. coli BL21 (DE3)."
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月28日
  11. 上野 博史、皆川 慶嘉、山登 一郎、村田 武士、飯野 亮太、宗行 英朗
    "Direct observation of the rotation of V1-ATPase from Enterococcus hirae and its torque"
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月28日
  12. 皆川 慶嘉、上野 博史、石塚 芳子、大沢 登、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、野地 博行、村田 武士、飯野 亮太
    "Basic properties of rotary dynamics of Enterococcus hirae V1-ATPAse motor protein"
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月29日
  13. 安田 賢司、尾嶋 拓、村田 武士、木下 正弘
    "Theoretical Enhancement of Structural Stability of a Membrane Protein for X-ray Crystallography"
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月30日
  14. 井阪 悠太、山登 一郎、村田 武士、池口 満徳
    "Rotation mechanism of V1-ATPase studied by steered MD simulations"
    第51回日本生物物理学会年会(ポスター発表)　京都　2013年10月30日

招待講演

  1. 村田 武士
    "創薬のための立体構造解析"
    第17回日本がん分子標的治療学会学術集会(ランチョンセミナー6)　京都　2013年6月14日
  2. Takeshi Murata
    "Rotation mechanism of Enterococcus hirae V1-ATPase based on asymmetric crystal structures"
    Gordon Research Conference in Molecular and Cellular Bioenergetics　New Hampshire (USA)　2013年6月26日
  3. 村田 武士
    "創薬のための立体構造解析"
    先端科学技術研究センター講演会「先端生命コロキウム」　東京　2013年7月17日
  4. 村田 武士
    "創薬標的膜タンパク質のX線結晶構造解析に向けた技術開発の現状"
    第53回生命科学夏の学校(生化学若い研究者の会)　静岡　2013年8月30日
  5. 村田 武士
    "創薬につながるV-ATPaseの構造と機能"
    第86回生化学会大会 シンポジウム　横浜　2013年9月12日
  6. Takeshi Murata
    "Generation of functional antibodies for human membrane protein crystallography"
    2013 DASAN Conference "Antibody Technologies for Future Biotherapeutics" Plenary Session I　Gangwon (Korea)　2013年10月31日 (基調講演)

プレスリリース

  1. 骨粗鬆症やがん転移に関与する分子モーターの回転の仕組みを解明 −明らかになった構造と動作原理に基づいた治療薬の開発が可能に−
    2013年1月8日

紹介記事

  1. 「千葉大や京大など、V型ATPaseの回転分子モーター部分の詳細構造を解明」
    『日経プレスリリース』　2013年1月14日
  2. 「千葉大など、分子モーター『V型ATPase』の回転機構を詳細に解明」
    『マイナビニュース』　2013年1月14日
  3. 「骨粗鬆症やがん転移に関与する分子モーター 回転の仕組みを解明」
    『物構研トピックス』　2013年1月18日
  4. 「Asymmetry makes the protein pump go round」
    RIKEN RESEARCH Vol. 8, No. 5, 13 (May 2013)
  5. 「構造生物学：V1-ATP アーゼの回転機構」
    Nature Digest Vol. 10, No. 3, 36 (May 2013)
  6. 「分子モーターの『回転する原理』を解明！」
    Nature Digest Vol. 10, No. 6, 20-21 (June 2013)