生体構造化学研究室

▶ 2008年 - 研究成果

発表論文

  1. *Atsushi Suenaga, Osamu Umezu, Tadashi Ando, Ichiro Yamato, Takeshi Murata, and Makoto Taiji
    "Estimation of ligand binding free energies of F-ATPase by using molecular dynamics/free energy calculation"
    J. Comput. Chem. Jpn. 7, 103-116 (2008).
  2. Keisuke Ito, Taishi Sugawara, Mitsunori Shiroishi, Natsuko Tokuda, Azusa Kurokawa, Takumi Misaka, Hisayoshi Makyio, Takami Yurugi-Kobayashi, Tatsuro Shimamura, Norimichi Nomura, Takeshi Murata, Keiko Abe, *So Iwata, and *Takuya Kobayashi
    "Advanced method for high-throughput expression of mutated eukaryotic membrane proteins in Saccharomyces cerevisiae"
    Biochem. Biophys. Res. Commu. 371, 841-845 (2008).
  3. Misaki Yamamoto, Satoru Unzai, Shinya Saijo, Kazuki Ito, Kenji Mizutani, Chiyo Suno-Ikeda, Yukako Yabuki-Miyata, Takaho Terada, Mitsutoshi Toyama, Mikako Shirouzu, Takuya Kobayashi, Yoshimi Kakinuma, Ichiro Yamato, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and *Takeshi Murata
    "Interaction and Stoichiometry of the Peripheral Stalk Subunits NtpE and NtpF and the N-terminal hydrophilic domain of NtpI, of Enterococcus hirae V-ATPase"
    J. Biol. Chem. 283, 19422-19431 (2008).
  4. *Takeshi Murata, Ichiro Yamato, Yoshimi Kakinuma, Mikako Shirouzu, John E. Walker, Shigeyuki Yokoyama, and So Iwata
    "Ion binding and selectivity of the rotor ring of the Na+-transporting V-ATPase"
    Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 105, 8607-8612 (2008).

特許

  1. 整理番号：E084P01　出願番号：2008-322607　出願日：2008年12月18日
    "膜貫通型タンパク質抗体の抗原結合部位を決定する方法"
    荒川 孝俊、村田 武士、岩田 想
  2. 整理番号：E084P02　出願番号：2008-307507　出願日：2008年12月2日
    "改変CBBを用いた新規Clear Native電気泳動法"
    村田 武士、岩田 想、日野 智也、菅 敏幸

学会等における発表

  1. Misaki Yamamoto, Satoru Unzai, Shinya Saijo, Kazuki Ito, Kenji Mizutani, Yoshimi Kakinuma, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, So Iwata, and Takeshi Murata
    "Stoichiometry and solution structure of the peripheral stalk subunits of Enterococcus hirae V-ATPase"
    第46回日本生物物理学会年会　福岡　2008年12月3日
  2. Kenji Mizutani, Chiyo Suno-Ikeda, Ryoko Ohno, Yoshimi Kakinuma, Ichiro Yamato, So Iwata, and Takeshi Murata
    "Engineering of the rotor ring of the Na+ motive V-ATPase from Enterococcus hirae to examine the stoichiometry"
    第46回日本生物物理学会年会　福岡　2008年12月4日
  3. Atsushi Suenaga, Osamu Umezu, Tadashi Ando, Ichiro Yamato, Takeshi Murata, and Makoto Taiji
    "Estimation of ligand binding free energies of F-ATPase by using molecular dynamics/free energy calculation"
    第46回日本生物物理学会年会　福岡　2008年12月5日
  4. 日野 智也、荒川 孝俊、寿野 千代、岩田 想、村田 武士
    "Brevibacillus分泌発現系を用いたリコンビナント抗体フラグメントの生産"
    第81回日本生化学会大会　神戸　2008年12月9日
  5. 山本 三沙岐、水谷健 二、白石 充典、小林 拓也、柿沼 喜己、山登 一郎、岩田 想、村田 武士
    "腸内連鎖球菌V型ATPaseの膜内在性サブユニット(NtpI)の発現と精製"
    第81回日本生化学会大会　神戸　2008年12月10日
  6. 荒川 孝俊、日野 智也、寿野 千代、岩成 宏子、児玉 龍彦、浜窪 隆雄、岩田 想、村田 武士
    "BIAcoreを用いたGPCR-モノクローナル抗体間の親和性解析"
    第81回日本生化学会大会　神戸　2008年12月11日

招待講演

  1. 村田 武士
    "膜超分子モーター(V型ATPase)のX線結晶構造解析とその展望"
    ERLサイエンス研究会　筑波　2008年3月17日
  2. 村田 武士
    "膜タンパク質のX線結晶構造解析 (V型ATPaseの構造解析を中心に)"
    名古屋工業大学物理化学セミナー　名古屋　2008年7月31日

新聞発表

  1. 「イオンバランス保つ酵素ポケット 構造、メカニズム解明」
    『京都新聞』夕刊　2008年6月17日

受賞

  1. 平成17年度採用基礎科学特別研究員成果発表会　ポスター賞　2008年1月28日