▶ 2018 - Activity

Publications

  1. Yuta Kajiwara, Satoshi Yasuda, Simon Hikiri, Tomohiko Hayashi, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata*, and Masahiro Kinoshita*
    "Physical Origin of Thermostabilization by a Quadruple Mutation for the Adenosine A2a Receptor in the Active State"
    J. Phys. Chem. B, 122, 4418–4427 (2018).
  2. Nanao Suzuki, Yuuki Takamuku, Tomohiro Asakawa, Makoto Inai, Tomoya Hino, So Iwata, Toshiyuki Kan, *Takeshi Murata
    "An efficient screening method for purifying and crystallizing membrane proteins using modified clear-native PAGE"
    Anal. Biochem., 548, 7–14 (2018).
  3. *Hiroshi Ueno, Kano Suzuki, Takeshi Murata*
    "Structure and dynamics of rotary V1 motor"
    Cell Mol. Life Sci., 75, 1789-1802 (2018).
  4. Shinji Yamada, Mika K. Kaneko, Shunsuke Itai, Yao-Wen Chang, Takuro Nakamura, Miyuki Yanaka, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata, Hiroaki Uchida, Hideaki Tahara, Hiroyuki Harada, and *Yukinari Kato
    "Epitope Mapping of Monoclonal Antibody PMab-48 Against Dog Podoplanin"
    Monoclon. Antib. Immunodiagn. Immunother., 37, 162-165 (2018).
  5. Jun Tsunoda, Chihong Song, Fabiana Lica Imai, Junichi Takagi, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino, and *Kazuyoshi Murata
    "Off-axis rotor in Enterococcus hirae V-ATPase visualized by Zernike phase plate single-particle cryo-electron microscopy"
    Sci. Rep., 8, 15632 (2018).
  6. Shinji Yamada, Shunsuke Itai, Yoshikazu Furusawa, Masato Sano, Takuro Nakamura, Miyuki Yanaka, Saori Handa, Kayo Hisamatsu, Yoshimi Nakamura, Masato Fukui, Hiroyuki Harada, Takuya Mizuno, Yusuke Sakai, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata, Hiroaki Uchida, Hideaki Tahara, Mika K. Kaneko, and *Yukinari Kato
    "Detection of Tiger Podoplanin Using the Anti-Cat Podoplanin Monoclonal Antibody PMab-52"
    Monoclon. Antib. Immunodiagn. Immunother., 37, 224-228 (2018).
  7. *Ryoji Suno, Sangbae Lee, Shoji Maeda, Satoshi Yasuda, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Shoichiro Horita, Maki S. Tawaramoto, Hirokazu Tsujimoto, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita, Nagarajan Vaidehi, Masaki Yamamoto, Brian K Kobilka, Nagarajan Vaidehi, So Iwata, *Takuya Kobayashi
    "Structural insights into the subtype-selective antagonist binding to the M2 muscarinic receptor"
    Nat. Chem. Biol., 14, 1150-1158 (2018).

Presentations

  1. Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Statistical thermodynamics for remarkably high thermal stability of thermophilic rhodopsin"
    The Second Symposium of Chiral Molecular Science and Technology in Chiba University -Advanced Materials Science, Biology & Nanophotonics in Chiba-千葉大学、2018年1月11日-12日
  2. 村田武士、木下正弘
    "統計熱力学に基づく膜タンパク質の熱安定化変異体予測法の開発(膜超分子モーターの相関構造解析による分子メカニズムの解明)"
    ＣＲＥＳＴ／さきがけ構造生命研究領域合同成果報告会、東京、2018年1月26日
  3. Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Theoretical Identification of Hot-Spot Residues to be Mutated Common in G Protein-Coupled Receptors of Class A"
    Biophysical Society 62nd Annual Meeting(ポスター発表), San Francisco, CA, 2018年2月19日
  4. Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, Ryota Iino
    "Chemo-Mechanical Coupling of Rotary Molecular Motor Enterococcus Hirae V1-ATPase as Revealed by Single-Molecule Analysis"
    Biophysical Society 62nd Annual Meeting(ポスター発表), San Francisco, CA, 2018年2月19日
  5. Kajiwara, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Hot-Spot Residues to be Mutated Common in G Protein-Coupled Receptors of Class A: Identification of Thermostabilizing Mutations Followed by Determination of Three-Dimensional Structures for Two Example Receptors"
    Biophysical Society 62nd Annual Meeting(ポスター発表), San Francisco, CA, 2018年2月19日
  6. 佐野 大輔、松﨑 厚志、武田祐希 、村田武士、須藤雄気、石井 久夫
    "高感度紫外光電子分を用いた受容タンパク質サーモフィリックロドプシンの電子構造の直接観測"
    第65回応用物理学会, 東京, 2018年3月17日
  7. Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Yuuki Takamuku, Nanao Suzuki, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Identification of thermostabilizing mutations for G-protein coupled receptors: Rapid method based on statistical thermodynamics"
    International symposium on “Artificial cell reactor science and technology”, 東京, 2018年4月5日
  8. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "X線結晶構造解析を用いたシャフトレスV1-ATPaseの非対称構造形成機構の探索"
    量子生命科学研究会第2回学術集会、東京、2018年5月10日
  9. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "V型ATPase触媒ドメインの非対称で準安定な構造形成メカニズム"
    MCRC Symposium、千葉、2018年6月14日
  10. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "N 末端側βバレルドメインのクラウン構造が非対称性を生み、恊動性を付与する"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月26日
  11. Fabiana L Yakushiji, Jun Tsunoda, Chihong Song, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Satoshi Ogasawara, Junichi Takagi, Kazuyoshi Murata, Takeshi Murata
    "Immobilization of conformational state of E.hirae V-ATPase complex using PA tag system for structural analysis"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月26日
  12. 佐久間 航也、杉木 俊彦、鈴木 花野、小林 直也、小杉 貴洋、小林 直宏、 村田 武士、古賀 理恵、古賀 信康
    "all-αタンパク質のデザイン"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月26日
  13. 鈴木 七緒、高椋 勇樹、吉田 千香、村田 武士
    "大腸菌発現系を用いたヒト由来 A2Aアデノシン受容体の発現・精製検討"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月27日
  14. Daisuke Takahashi, Kano Suzuki, Taiichi Sakamoto, Takeo Iwamoto, Takeshi Murata, Fumio Sakane
    "Molecular basis for the intramolecular regulation of DGK α : analysis of Ca2+ induced conformational changes in N-terminal EF-hand motifs"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月27日
  15. 三本 斉也、村田 武士、古賀 信康
    "G タンパク質共役受容体の不安定領域の再デザイン"
    第18回日本蛋白質科学会年会、新潟 朱雀メッセ、2018年6月28日
  16. Kouki Shimizu, Fabiana Lica Yakushiji, Katsuhiko Moriyama, Takayoshi Arai, Takeshi Murata
    "Identification of inhibitors & accelerators on Na+-depending ATPase activity of Enterococcus hirae V-ATPase"
    1st International Symposium of Soft Molecular Activation Research Center、千葉、2018年8月31日
  17. Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, and Ryota Iino
    "Chemo-mechanical coupling scheme of rotary molecular motor V1-ATPase revealed by single-molecule analysis"
    The 79th Okazaki Conference、岡崎、2018年9月1日
  18. Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, and Masahiro Kinoshita
    "Statistical thermodynamics on the large difference between thermophilic rhodopsin and xanthorhodopsin in terms of thermostability"
    The 79th Okazaki Conference、岡崎、2018年9月1日
  19. Tomoki Akiyama, Kano Suzuki, Kanae Kanehara, Satoshi Yasuda, Yuki Sudo, Takeshi Murata
    "High-resolution crystal structure of thermostable rhodopsin of Rubrobacter xylanophilus"
    The 79th Okazaki Conference、岡崎、2018年9月1日
  20. Daisuke Sano, Ichiro Ide, Yuki Takeda, Yuya Tanaka, Takeshi Murata, Yuki Sudo, and Hisao Ishii
    "High-Sensitivity UV Photoemission-Related Spectroscopies of Biomolecules"
    2018 KJF International Conference on Organic Materials for Electronics and Photonics、岐阜、2018年9月4日
  21. Koya Sakuma, Naohiro Kobayashi, Kano Suzuki, Toshihiko Sugiki, Naoya Kobayashi, Takahiro Kosugi, Takeshi Murata, Toshimichi Fujiwara, Rie Koga, Nobuyasu Koga
    "Design of all-α proteins"
    第56回日本生物物理学会年会 (口頭発表)、岡山大学、2018年9月15日
  22. Daisuke Sano, Yuki Takeda, Tomoki Akiyama, Kanae Kanahara, Takeshi Murata, Yuki Sudo, Hisao Ishi
    "Electronic structure of a film with TR observed by technique using photoelectron emission 2: Comparison with RxR"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月16日
  23. Ichiro Ide, Daisuke Sano, Shintaro Maruyama, Yuya Tanaka, Takeshi Murata, Hisao Ishii
    "Gap state of lysozyme thin film observed by high-sensitivity UV photoelectron spectroscopy"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月16日
  24. Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Yuta Kajiwara, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Physical origin of exceptionally high thermostability of thermophilic rhodopsin"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月17日
  25. Tomoki Akiyama, Keigo Nishikawa, Sayaka Nemoto, Satoshi Yasuda, Daisuke Umeno, Masahiro Kinoshita, Yuki Sudo, Takeshi Murata
    "Thermostabilization of the microbial rhodopsin TR by carotenoid binding and amino-acid mutation"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月17日
  26. Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Kano Suzuki, Tomoki Akiyama, Kanae Kanehara, Yuki Sudo, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Statistical thermodynamics for the extremely high thermostability of a microbial rhodopsin from the eubacterium Rubrobacter (RxR)"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月17日
  27. Masaya Mitsumoto, Ryosuke Nakano, Takeshi Murata, Nobuyasu Koga
    "Rational Design of G-Protein Coupled Receptors Stabilized in Aimed State"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月17日
  28. Jun Tsunoda, Chihong Song, Fabiana Lica Yakushiji, Takeshi Murata, Hiroshi Ueno, Naoyuki Miyazaki, Kenji Iwasaki, Junichi Takagi, Ryota Iino, Kazuyoshi Murata
    "Single Particle Analysis of EhV-ATPase by Phase-Plate electron cryo-microscopy"
    第56回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、岡山大学、2018年9月15日
  29. Shingo Sato, Nanao Suzuki, Satoshi Yasuda, Yuta Kaziwara, Hiroki Nakai, Kinuka Isshiki, Tomoaki Matsuura, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
    "Efficient screening system construction to create thermo-stabilized GPCR mutants using theoretical calculation and evolutional engineering"
    日本分子生物学会、パシフィコ横浜、2018年11月30日
  30. 佐藤愼吾、鈴木七緒、梶原佑太、安田賢司、仲井宏紀、一色衣香、松浦友亮、木下正弘、村田武士
    "理論計算と進化分子工学を融合したGPCR安定化変異体スクリーニング系の構築"
    日本生体エネルギー研究会 第44回討論会、千葉大学、2018年12月7日
  31. 中野僚介、肥喜里志門、安田賢司、白石充典、木下正弘、村田武士
    "GPCR活性型変異体スクリーニング系の構築"
    日本生体エネルギー研究会 第44回討論会、千葉大学、2018年12月7日
  32. 扇谷和希、佐藤愼吾、鈴木七緒、安田賢司、白石充典、木下 正弘、村田武士
    "メラトニン1A受容体の高発現・熱安定化改変体の創出"
    日本生体エネルギー研究会 第44回討論会、千葉大学、2018年12月7日
  33. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、イマイ ファビアナ リカ、石塚（桂） 芳子、木村（染谷） 友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "N末端βバレルクラウンがV1モーターの非対称構造形成に寄与する"
    日本生体エネルギー研究会 第44回討論会、千葉大学、2018年12月7日

Invited lectures

  1. 村田 武士
    "膜タンパク質のX線結晶構造解析の展望"
    日本分析化学会　X線分析研究懇談会　例会、千葉、2018年1月29日
  2. Takeshi Murata
    "Disruptive technology to creat thermostabilized mutants of G-protein coupled receptors"
    International symposium on “Artificial cell reactor science and technology”, 東京, 2018年4月5日
  3. Takeshi Murata
    "Structure and functional analysis of V-ATPase for drug development"
    The 3rd international GTP workshop, 東京, 2018年5月18日
  4. Takeshi Murata
    "Further thermostabilization of thermophilic rhodopsin TR"
    23th Biophysics Conference in Taiwan、台中（台湾）, 2018年5月24日
  5. 村田 武士
    "理論計算を用いた膜蛋白質の耐熱化法の開発"
    第４回蛋白質工学研究会、新潟、2018年6月25日
  6. Takeshi Murata
    "Further thermostabilization of Microbial rhodopsins"
    The 79th Okazaki Conference、岡崎、2018年8月31日
  7. 村田 武士
    "将来を担う若手研究者及び学生に向けた研究モチベーションアップ法"
    千葉大学グローバルプロミネント研究基幹シンポジウム (第３回)、千葉、2018年11月6日

Award

  1. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "X線結晶構造解析を用いたシャフトレスV1-ATPaseの非対称構造形成機構の探索"
    量子生命科学研究会 第2回学術集会 ポスターセッション 優秀賞、東京、2018年5月10日
  2. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、今井 ファビアナ・リカ、石塚(桂)芳子、 染谷(木村)友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤 敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "V型ATPase触媒ドメインの非対称で準安定な構造形成メカニズム"
    MCRC Symposium Best Poster賞、千葉、2018年6月14日
  3. 丸山 慎太郎、鈴木 花野、今村 元紀、佐々木 輝、松波 秀行、水谷 健二、齋藤 靖子、イマイ ファビアナ リカ、石塚（桂） 芳子、木村（染谷） 友美、白水 美香子、内橋 貴之、安藤敏夫、山登 一郎、村田 武士
    "N末端βバレルクラウンがV1モーターの非対称構造形成に寄与する"
    日本生体エネルギー研究会 第44回討論会 最優秀ポスター賞、千葉大学、2018年12月7日

Press release

  1. "Ｇタンパク質共役型受容体（GPCR）の 耐熱化に繋がる「ホットスポット」を発見-創薬標的GPCRの大量生産が可能に-"
    平成３０年１２月５日

Press release

  1. "受容体の耐久性向上（千葉大など　新薬効率開発に道）"
    日経産業新聞, 2018年12月20日