▶ 2017 - Activity

Publications

  1. Yuta Kajiwara, Satoshi Yasuda, Yuuki Takamuku, *Takeshi Murata, and *Masahiro Kinoshita
    "Identification of Thermostabilizing Mutations for a Membrane Protein Whose Three-Dimensional Structure is Unknown"
    J. Comput. Chem., 38, 211–223 (2017).
  2. Mika K. Kaneko, Shinji Abe, Satoshi Ogasawara, Yuki Fujii, Shinji Yamada, Takeshi Murata, Hiroaki Uchida, Hideaki Tahara, Yasuhiko Nishioka, and *Yukinari Kato
    "Chimeric Anti-Human Podoplanin Antibody NZ-12 of Lambda Light Chain Exerts Higher Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity and Complement-Dependent Cytotoxicity Compared with NZ-8 of Kappa Light Chain"
    Monoclon. Antib. Immunodiagn. Immunother., 36, 1–5 (2017).
  3. *Yukinari Kato, Akiko Kunita, Masashi Fukayama, Shinji Abe, Yasuhiko Nishioka, Hiroaki Uchida, Hideaki Tahara, Shinji Yamada, Miyuki Yanaka, Takuro Nakamura, Noriko Saidoh, Kanae Yoshida, Yuki Fujii Ryusuke Honma, Michiaki Takagi, Satoshi Ogasawara, Takeshi Murata, and Mika K. Kaneko
    "Antiglycopeptide Mouse Monoclonal Antibody LpMab-21 Exerts Antitumor Activity Against Human Podoplanin Through Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity and Complement-Dependent Cytotoxicity"
    Monoclon. Antib. Immunodiagn. Immunother., 36, 20–24 (2017).
  4. Yuta Isaka, Toru Ekimoto, Yuichi Kokabu, Ichiro Yamato, Takeshi Murata, and *Mitsunori Ikeguchi
    "Rotation Mechanism of Molecular Motor V1-ATPase Studied by Multiscale Molecular Dynamics Simulation"
    Biophys. J., 112, 911–920 (2017).
  5. Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, *Takeshi Murata, and *Masahiro Kinoshita
    "Hot-Spot Residues to be Mutated Common in G Protein-Coupled Receptors of Class A: Identification of Thermostabilizing Mutations Followed by Determination of Three-Dimensional Structures for Two Example Receptors"
    J. Phys. Chem. B, 121, 6341–6350 (2017).
  6. *Ichro Yamato, Takeshi Murata and Andrei Khrennikov
    "Energy and information flows in biological systems: Bioenergy transduction of V1-ATPase rotary motor and dynamics of thermodynamic entropy in information flows"
    Prog. Biohys. Mol. Biol., 130, 33–38 (2017).

Reviews

  1. 木下正弘、村田武士
    "膜タンパク質の耐熱化につながるアミノ酸置換の理論的予測"
    バイオサイエンスとインダストリー, バイオインダストリー協会, 75, 33–36 (2017).
  2. 鈴木花野、村田武士
    "回転分子モーター（V1-ATPase）の分子メカニズム"
    医学のあゆみ, 医歯薬出版, 262, 353–359 (2017).

Presentations

  1. Michiko Takeda, Nanao Suzuki, Satoshi Yasuda, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
    "Purification and crystallization of follicle stimulating hormone receptor (FSHR)"
    The Second Symposium of Chiral Materials science 2017 (ポスター発表), 千葉大学, 2017年3月8日-9日
  2. Tomoyuki Hiroi, Satoshi Yasuda, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
    "Establishment of high yield production system of scFv antibody using E. coli expression system"
    The Second Symposium of Chiral Materials science 2017 (ポスター発表), 千葉大学, 2017年3月8日-9日
  3. Yuki Shibata, Manabu Magarisawa, Katsuhiko Miyamoto, Takashige Omatsu, Takeshi Murata
    "Development of new protein crystallization technology using optical vortex"
    The Second Symposium of Chiral Materials science 2017 (ポスター発表), 千葉大学, 2017年3月8日-9日
  4. Takeshi Murata
    "N-terminal β-barrel domain constraint gives rise the asymmetrical motor structure of V1-ATPase to provide cooperativity"
    Gordon Research Conference in Molecular and Cellular Bioenergetics, New Hampshire, 2017年6月4日
  5. 安田賢司、梶原佑太、高椋勇樹、鈴木七緒、村田武士、木下正弘
    "統計熱力学に基づいたG蛋白質共役型受容体耐熱化アミノ酸変異体の理論的予測"
    第17回日本蛋白質科学会年会 (口頭発表)、仙台国際センター 、2017年6月22日
  6. Nanao Suzuki, Takeshi Murata
    "The development of E. coli expression system for G protein-coupled receptors"
    第17回日本蛋白質科学会年会 (ポスター発表)、仙台国際センター 、2017年6月22日
  7. Shintaro Maruyama, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Fabiana Lica Yakushiji, Yoshiko Ishiduka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "Crystal structure of a single mutant of the catalytic A3B3 complex in the β-barrel domain"
    第17回日本蛋白質科学会年会 (ポスター発表)、仙台国際センター 、2017年6月22日 　
  8. 三本 斉也、村田 武士、古賀 信康
    "安定なGタンパク質共役受容体の合理デザイン"
    第17回日本蛋白質科学会年会 (ポスター発表)、仙台国際センター 、2017年6月20-22日
  9. 小笠原 諭、村田 武士
    "膜蛋白質の結晶化を促進するモノクローナル抗体作製技術基盤の開発"
    第12回 トランスポーター研究会年会 (ポスター発表)、東北大学 片平キャンパス さくらホール、2017年7月8-9日
  10. Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Yosuke Toyoda, Kazushi Morimoto, Ryoji Suno, So Iwata, Takuya Kobayashi, Takeshi Murata and Masahiro Kinoshita
    "Theoretical Identification of Hot-Spot Residues to be Mutated Common in G Protein-Coupled Receptors of Class A"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  11. Shintaro Maruyama, Kano Suzuki, Hikaru Sasaki, Kenji Mizutani, Yasuko Saito, Fabiana L. Yakushiji, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "n N-terminal β-barrel head-band gives rise to the asymmetrical motor structure of V1-ATPase and promotes cooperativity"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  12. Simon Hikiri, Ryosuke Nakano, Nanao Suzuki, Satoshi Yasuda, Yuta Kajiwara, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
    "Identification of Thermostabilizing Mutations for a G-protein coupled receptor in the active state"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  13. Yuta Kajiwara, Satoshi Yasuda, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Physical origin of stabilization by a quadruple mutation for the adenosine A2a receptor in the active state"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  14. Motonori Imamura, Kazuya Nakamoto, Shintaro Maruyama, Fumihiro Kawai, Ryota Iino, Takayuki Uchihashi, Takeshi Murata, Toshio Ando
    "Analysis of Rotational Dynamics of Rotorless Enterococcus hirae V1-ATPase using High-Speed Atomic Force Microscopy"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  15. Daisuke Sano, Astushi Matsuzaki, Yuki Takeda, Takuya Miyauchi, Takeshi Murata, Yuki Sudo, Hisao Ishii
    "Electronic structure of a thermophilic rhodopsin film observed by techniques using photoelectron emission"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  16. Tatsuya Iida, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Fumihiro Kawai, Takeshi Murata, Ryota Iino
    "Substeps and chemo-mechanical coupling scheme of rotary molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase"
    第５５回日本生物物理学会年会 (口頭発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月19日
  17. Keigo Nishikawa, keiichi Kojima, Shigeko Kawai-Noma, Sayaka Nemoto, Takeshi Murata, Daisuke Umeno, Yuki Sudo
    "Production of a light-driven proton pump TR interacted with light-harvesting carotenoid antennae"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月21日
  18. Jun Tsunoda, Chihong Song, Takeshi Murata, Hiroshi Ueno, Naoyuki Miyazaki, Kenji Iwasaki, Ryota Iino, Kazuyoshi Murata
    "Single Particle Analysis of EhV-ATPase by Phase-Plate electron cryo-microscopy"
    第５５回日本生物物理学会年会 (ポスター発表)、熊本大学 黒髪北地区、 2017年9月21日
  19. Junhyung Lee, Takeshi Murata, Katsuhiko Miyamoto, Takashige Omatsu
    "Crystal growth of glycine by optical trapping with an optical field with optical angular momentum"
    OSJ - OSA Joint Symposia on Nanophotonics and Digital Photonics, 東京大学, 2017年10月30-31日
  20. 安田賢司、梶原佑太、村田武士、木下正弘
    "サーモフィリックロドプシンの極めて高い熱安定性に対する統計熱力学的解析"
    日本生体エネルギー研究会 第４３回討論会(ポスター発表)、京都産業大学 むすびわざ館、2017年12月19-21日

Invited lectures

  1. 村田 武士
    "ATPaseの構造と機能"
    第90回日本細菌学会総会、仙台、2017年3月21日
  2. 村田 武士
    "回転分子モーターの酵素反応機構の完全理解に向けて"
    第一回量子生命科学研究会、東京、2017年4月12日
  3. 村田 武士
    "回転分子モーターの分子メカニズムの完全理解に向けて"
    東北大学応用微生物学セミナー、仙台、2017年7月7日
  4. 村田 武士
    "膜タンパク質の構造解析のボトルネックと解決策"
    第12回トランスポーター研究会(特別講演)、仙台、2017年7月8日
  5. Takeshi Murata
    "Molecular mechanism of the structural formation of V1 rotary motor"
    第53回日本生物物理学会　シンポジウム、熊本、2017年9月19日
  6. 村田 武士
    "X線を用いた膜タンパク質の結晶構造解析の展望"
    KEK物質構造科学研究所 設立20周年記念シンポジウム、筑波、2017年12月27日