▶ 2014 - Activity

Publications

  1. 村田 武士
    "膜超分子回転モーター（V-ATPase) の分子メカニズム"
    実験医学 増刊 Vol. 32, No. 10, 1623-1626 (2014).
  2. Suharni, Yayoi Nomura, Takatoshi Arakawa, Tomoya Hino, Hitomi Abe, Yoshiko Nakada-Nakura, Yumi Sato, Hiroko Iwanari, Mitsunori Shiroishi, Hidetsugu Asada, Tatsuro Shimamura, Takeshi Murata, Takuya Kobayashi, Takao Hamakubo, *So Iwata and *Norimichi Nomura
    "Proteoliposome-based Selection of a Recombinant Antibody Fragment Against the Human M2 Muscarinic Acetylcholine Receptor"
    Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy, 33, 378–385 (2014).
  3. Hiroshi Ueno, Yoshihiro Minagawa, Mayu Hara, Suhaila Rahman, Ichiro Yamato, Eiro Muneyuki, Hiroyuki Noji, *Takeshi Murata, and *Ryota Iino
    "Torque generation of Enterococcus hirae V-ATPase"
    J. Biol. Chem., 289, 31212-31223 (2014).
  4. Kano Suzuki and Takeshi Murata
    "Rotation mechanism of V1-ATPase"
    SPring-8 Research Frontiers, 2013, 22-23 (2014).
  5. 鈴木 花野、村田 武士
    "非対称結晶構造からみえてきたV1-ATPaseの回転メカニズム"
    医学のあゆみ, 医歯薬出版, 249, 551-552 (2014).
  6. 村田 武士
    "回転分子モーターの動作原理―F1モーターとV1モーターの違い―"
    生物物理 54 (2), 079-084 (2014/4月号).
  7. Takaho Terada, Takeshi Murata, Mikako Shirouzu and *Shigeyuki Yokoyama
    "Cell-free expression of protein complexes for structural biology"
    Methods Mol. Biol., 1091, 151-159 (2014).
  8. 日野智也、岩田想、村田 武士
    "改変型CBBを用いた新規Clear Native電気泳動法"
    生物物理化学, Vol 58, No.2, 18-20 (2014).
  9. *Ryota Iino, Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Maya Hara and Takeshi Murata
    "Molecular Structure and Rotary Dynamics of Enterococcus hirae V1-ATPase"
    IUBMB Life, 66, 624-630 (2014).

Presentations

  1. Yuuki Takamuku, Atsushi Suenaga, Kenji Mizutani, and Takeshi Murata
    "New drug creation based on the crystal structure of adenosine A2A receptor"
    58th Annual Meeting of the Biophysical Society(ポスター発表)　San Francisco (USA)　2014年2月18日
  2. 高椋 勇樹、末永 敦、水谷 健二、村田 武士
    "アデノシンA2A受容体に対する新規アロステリック阻害剤の同定"
    日本化学会 第94回春期年会2014(ポスター発表)　名古屋　2014年3月27日
  3. Hiroshi Ueno, Yoshihiro Minagawa, Mayu Hara, Takeshi Murata, Ryota Iino, and Eiro Muneyuki
    "Interactions between Rotor and Stator in Enterococcus hirae V-ATPase"
    Tokyo ATPase Workshop 2014(ポスター発表）東京　2014年6月2日
  4. Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "Crystal structure of phosphate-bound V1-ATPase"
    Tokyo ATPase Workshop 2014(ポスター発表）東京　2014年6月2日
  5. Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Mayu Hara, Hiroyuki Noji, Takeshi Murata, and Ryota Iino
    "Basic properties of rotary dynamics of the molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase"
    Tokyo ATPase Workshop 2014(ポスター発表）東京　2014年6月2日
  6. 飯野 亮太、皆川 慶嘉、上野 博史、村田 武士
    "Basic properties of rotary dynamics of the molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase"
    第14回蛋白質科学会(ポスター発表）横浜、2014年6月26日
  7. Kano suzuki, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato and Takeshi Murata
    "Crystal structure of phosphate-bound V1-ATPase of Enterococcus hirae"
    The 28th Annual Symposium of the Protein Society(ポスター発表) San Diego(アメリカ)、2014年7月27日
  8. Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Mayu Hara, Hiroyuki Noji, Takeshi Murata and Ryota Iino
    "The role of amino acid residues located at the catalytic site in the rotation of Enterococcus hirae V1-ATPase"
    第52回日本生物物理学会(ポスター発表)、札幌、2014年9月25日
  9. Kazuya Nakamoto, Kenji Mizutani, Kano Suzuki, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "Crystal structure of ADP-bound A3B3 complex of Enterococcus hirae V-ATPase"
    第52回日本生物物理学会(ポスター発表)、札幌、2014年9月25日
  10. Hiroshi Ueno, Yoshihiro Minagawa, Mayu Hara, Ichiro Yamato, Hiroyuki Noji, Takeshi Murata, Ryota Iino, and Eiro Muneyuki
    "Rotor-stator interactions in V1 and Vo from Enterococcus hirae V-ATPase"
    第52回日本生物物理学会(ポスター発表)、札幌、2014年9月27日
  11. Yuta Isaka, Takeshi Murata, Mitsunori Ikeguchi
    "Rotation mechanism of V1-ATPase studied by MD simulation"
    第52回日本生物物理学会(ポスター発表)、札幌、2014年9月27日
  12. Yuta Kajiwara, Satoshi Yasuda, Yuki Takamuku, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita
    "Theoretical prediction of mutations improving thermal stability of Adenosin A2a receptor"
    第52回日本生物物理学会(ポスター発表)、札幌、2014年9月27日
  13. Taisuke Hasegawa, Yuki Sudo, Takeshi Murata and Shigehiko Hayashi
    "Assessing Molecular Mechanism of High Thermal Stability of Thermophilic Rhodopsin by Molecular Dynamics Simulation"
    16th International Conference on Retinal Proteins、長浜、2014年10月6日
  14. 鈴木 花野、水谷 健二、ヤクシジ ファビアナ リカ、石塚 芳子、寺田 貴帆、 白水 美香子、横山 茂之、山登 一郎、村田 武士
    "ADP結合型V1-ATPaseのX線結晶構造解析"
    日本生体エネルギー研究会第40回討論会(ポスター発表)、松山、2014年12月11日
  15. 稲辺 宏輔、山本 三沙岐、村田 武士、柿沼 喜己、山登 一郎
    "腸内連鎖球菌V-ATPase遺伝子群による大腸菌Na+/H+アンチポーター変異、F-ATPase変異の相補性"
    日本生体エネルギー研究会第40回討論会(ポスター発表)、松山、2014年12月12日
  16. Kazuya Nakamoto, Kenji Mizutani, Kano Suzuki, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "Crystal structure of ADP-bound A3B3 complex of Enterococcus hirae V-ATPase"
    韓国亜洲大学校ジョイントシンポジウム(ポスター発表)、千葉、2014年12月12日
  17. Hikaru Sasaki, Fabiana Yakushiji, Kenji Mizutani, Kano Suzuki, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
    "Crystal Structure of A1B1 Complex of Enterococcus hirae V-ATPase
    韓国亜洲大学校ジョイントシンポジウム(ポスター発表)、千葉、2014年12月12日

Invited lectures

  1. Takeshi Murata
    "Structural studies of mammalian membrane proteins using functional antibody fragments"
    IPR Seminar (Antibody Design, Modeling and Applications)　大阪　2014年1月15日
  2. Takeshi Murata
    "Crystallography of membrane proteins with antibody fragments for drug discovery"
    Workshop on Chirality in Chiba University, 2nd Symposium　 千葉　2014年1月31日
  3. Takeshi Murata
    "Rotation mechanism of V-ATPase based on crystal structures"
    Gordon Research Conference (Protons and Membrane Reactions)　Ventura (USA)　2014年2月27日
  4. Takeshi Murata
    "Rotation mechanism of V-ATPase"
    Tokyo ATPase Workshop 2014　東京　2014年6月3日
  5. 村田 武士
    "相関構造解析によるV１モーターの回転メカニズム"
    第14回蛋白質科学会　シンポジウム「構造生命科学をさきがける先端的基盤技術」、横浜、2014年6月25日
  6. 村田 武士
    "Crystallization methods of membrane proteins"
    第52回日本生物物理学会　シンポジウム「次世代タンパク質結晶化手法」、札幌、2014年9月25日
  7. Takeshi Murata
    "X-ray crystal structure of the proton pumping rhodopsin TR from the hyperthermoplile Thermus thermophilus"
    16th International Conference on Retinal Proteins、長浜、2014年10月6日
  8. 村田 武士
    "ヒト膜タンパク質の大量発現・精製・結晶化の技術開発"
    平成26年度日本結晶学会年会シンポジウム、東京、2014年11月3日
  9. 村田 武士
    "創薬標的膜蛋白質の体系的構造解析技術の確立に向けて"
    感染症研究グローバルネットワークフォーラム2014、千葉、2014年11月15日
  10. Takeshi Murata
    "Molecular mechanism of Enterococcus hirae V-ATPase"
    Barcelona BioMed Conference、 Barcelona（スペイン）, 2014年11月18日
  11. 村田 武士
    "Towards Establishment of Systematic Structure Analysis Technology for G-protein Coupled Receptors"
    第37回日本分子生物学会年会シンポジウム、横浜、2014年11月26日
  12. 村田 武士
    "創薬標的膜タンパク質のX線結晶構造解析に向けた技術開発"
    ハイテクリサーチプロジェクト公開シンポジウム、大阪、2014年12月6日

Patent

  1. 村田 武士、木下 正弘、安田 賢司、高椋 勇樹、水谷 健二
    "膜タンパク質の熱安定化変異体予測装置、熱安定化変異体予測方法、および、プログラム"
    H26.06.25、特願2014-130560号

Press release

  1. "たんぱく質GPCR　強度を高め調べやすく　創薬研究で活用期待"
    日経産業新聞　2014年7月25日.

Introductory article

  1. 訳 : 村田 武士 (Frank U. Axe)
    "GPCRの三次元モデリング、ドラッグデザイン（構造とリガンドに基づくアプローチ）"
    田之倉優、小島正樹 監訳、東京化学同人、262-270 (2014).