▶ 2011 - Activity

Publications

  1. Yuji Furutani, Takeshi Murata, and *Hideki Kandori
    "Sodium or Lithium Ion-Binding-Induced Structural Changes in the K-Ring of V-ATPase from Enterococcus hirae Revealed by ATR-FTIR Spcetroscopy"
    J. Am. Chem. Soc. 133, 2860-2863 (2011).
  2. K. M. Mozaffor Hossain, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Yoshimi Kakinuma, Takeshi Murata, and *Ichiro Yamato
    "Expression and purification of the central stalk subunits of Na+-translocating V-type ATPase from Enterococcus hirae"
    Afr. J. Biotechnol. 10, 2406-2413 (2011).
  3. 水谷 健二、岩田 想、*村田 武士
    "創薬につながるV-ATPase阻害剤の探索; 特集「次世代ケミカルバイオロジーの新展開」"
    化学工業 vol. 62, No. 2, 148-152 (2011).
  4. Suhaila Rahman, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Ichiro Yamato, Mitsutoshi Toyama, Noboru Ohsawa, Mio Inoue, Keiko Honda, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and *Takeshi Murata
    "Expression, purification and characterization of isoforms of peripheral stalk subunits of human V-ATPase"
    Prot. Exp. Purif. 78, 181-188 (2011).
  5. Natsuko Tokuda, Kiyohiko Igarashi, Tatsuro Shimamura, Takami Yurugi-Kobayashi, Mitsunori Shiroishi, Keisuke Ito, Taishi Sugawara, Hidetsugu Asada, Takeshi Murata, Norimichi Nomura, *So Iwata, and *Takuya Kobayashi
    "Cloning, expression and purification of the anion exchanger 1 homologue from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium"
    Prot. Exp. Purif. 79, 81-87 (2011).
  6. Hidetsugu Asada, Tomoko Uemura, Takami Yurugi-Kobayashi, Mitsunori Shiroishi, Tatsuro Shimamura, Hirokazu Tsujimoto, Keisuke Ito, Taishi Sugawara, Takanori Nakane, Norimichi Nomura, Takeshi Murata, Tatsuya Haga, *So Iwata, and *Takuya Kobayashi
    "Evaluation of the Pichia pastoris expression system for the production of GPCRs for structural analysis"
    Microb. Cell Fact. 10 24 (1-13) (2011).
  7. Miyuki Kawano-Kawada, Hiroko Takahashi, Kazuei Igarashi, Takeshi Murata, Ichiro Yamato, Michio Homma, and *Yoshimi Kakinuma
    "Significance of the glutamate-139 residue of the V-type Na+-ATPase NtpK subunit in catalytic turnover linked with salt tolerance of Enterococcus hirae"
    J. Bacteriol. 193, 3657-3661 (2011).
  8. Suhaila Rahman, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Ichiro Yamato, and *Takeshi Murata
    "Sarkosyl is a good regeneration reagent for studies on vacuolar-type ATPase subunit interactions in Biacore experiments"
    Anal. Biochem. 418, 301-303 (2011).
  9. Kenji Mizutani, Misaki Yamamoto, Kano Suzuki, Ichiro Yamato, Yoshimi Kakinuma, Mikako Shirouzu, John E Walker, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and *Takeshi Murata
    "Structure of the rotor ring modified with N,N'-dicyclohexylcarbodiimide of the Na+-transporting vacuolar ATPase"
    Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 13474-13479 (2011).
  10. Min Zhou, Nina Morgner, Nelson P. Barrera, Argyris Politis, Shoshanna C Isaacson, Dijana Matak-Vinković, Takeshi Murata, Ricardo A. Bernal, Daniela Stock, and *Carol V. Robinson
    "Mass Spectrometry of intact V-type ATPases reveals bound lipids and the effects of nucleotide binding"
    Science 334, 380-385 (2011).
  11. Shinya Saijo, Satoshi Arai, Khandoker M. M. Hossain, Kano Suzuki, Ichiro Yamato, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, and *Takeshi Murata
    "Crystal structure of the central axis DF complex of the prokaryotic V-ATPase"
    Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 19955-19960 (2011).

Presentations

  1. 古谷 祐詞、村田 武士、神取 秀樹
    "全反射赤外分光法によるV型ATPaseのNa+およびLi+イオン結合解離に伴う構造変化解析"
    第11回日本蛋白質科学会年会　大阪　2011年6月7日
  2. 日野 智也、松本 悠史、永野 真吾、杉本 宏、福森義宏、村田 武士、岩田 想、城 宜嗣
    "緑膿菌由来一酸化窒素還元酵素の結晶構造解析"
    第11回日本蛋白質科学会年会 若手奨励賞シンポジウム(ポスター発表、口頭発表)　大阪　2011年6月9日
  3. Takeshi Murata
    "Crystal structure of V1-ATPase from Enterococcus hirae"
    Gordon Research Conference in Molecular and Cellular Bioenergetics(ポスター発表、口頭発表)　New Hampshire (USA)　2011年6月30日
  4. 小笠原 諭、日野 智也、荒川 孝俊、小笠原 かほり、寿野 千代、野村 紀通、島村 達郎、小林 拓也、村田 武士、岩田 想
    "膜蛋白質の構造・機能解析を目指したモノクローナル抗体作製技術の開発"
    第84回日本生化学会大会 シンポジウム　京都　2011年9月24日
  5. 日野 智也、松本 悠史、永野 真吾、杉本 宏、福森 義宏、村田 武士、岩田 想、城 宜嗣
    "緑膿菌由来膜タンパク質一酸化窒素還元酵素の抗体を用いた結晶化と構造解析"
    第84回日本生化学会大会 シンポジウム　京都　2011年9月24日
  6. 野村 紀通、日野 智也、野村 弥生、安部 仁美、名倉 淑子、荒川 孝俊、岩成 宏子、新井 修、村田 武士、小林 拓也、浜窪 隆雄、島村 達郎、Drew David、岩田 想
    "膜蛋白質のX線結晶構造解析を支援する抗体工学技術の確立"
    第84回日本生化学会大会 シンポジウム　京都　2011年9月24日
  7. 新井 聡史、西條 慎也、山登 一郎、柿沼 喜己、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "腸内連鎖球菌由来V-ATPaseのNtpA3-B3複合体の構造と非対称性形成機構"
    第84回日本生化学会大会(ポスター発表、一般口頭発表)　京都　2011年9月22日
  8. 西條 慎也、新井 聡史、山登 一郎、柿沼 嬉巳、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "Enterococcus hirae由来V1-ATPaseの結晶構造解析"
    第84回日本生化学会大会(ポスター発表、一般口頭発表)　京都　2011年9月22日
  9. 森 永伍、水谷 健二、鈴木 花野、新井 聡史、西條 慎也、山登 一郎、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "AMP-PNPが1分子結合した腸球菌A3B3 複合体のX線結晶構造解析"
    第84回日本生化学会大会(ポスター発表、一般口頭発表)　京都　2011年9月22日
  10. 田村 愛美、水谷 健二、日野 智也、山本 三沙岐、David Drew、岩田 想、村田 武士
    "進化工学的手法によるヒト糖輸送体(GLUT)の高発現変異体の作製"
    第84回日本生化学会大会(ポスター発表)　京都　2011年9月22日
  11. 鮫島 大志郎、水谷 健二、日野 智也、山本 三沙岐、David Drew、岩田 想、村田 武士
    "進化工学的手法によるGPCRの高発現変異体のスクリーニング"
    第84回日本生化学会大会(ポスター発表)　京都　2011年9月22日
  12. 荒川 孝俊、小林 貴美、岩成 宏子、日野 智也、名倉 淑子、波多江 日成子、隈 博幸、Cameron Alexander、浜窪 隆雄、濱崎 直孝、岩田 想、小林 拓也、村田 武士
    "赤血球膜陰イオン交換輸送体(eAE1)膜ドメインの構造解析に向けた抗体の利用"
    第84回日本生化学会大会　京都　2011年9月22日
  13. 山本 三沙岐、水谷 健二、山登 一郎、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "ヒトV-ATPaseの中央回転軸のX線結晶構造解析"
    第84回日本生化学会大会　京都　2011年9月23日
  14. 水谷 健二、鈴木 花野、新井 聡史 、西條 慎也、山登 一郎、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "ヌクレオチド非存在下で得られた腸球菌由来V1-ATPaseの結晶構造"
    第84回日本生化学会大会　京都　2011年9月23日
  15. 鈴木 花野、水谷 健二、新井 聡史、西條 慎也、山登 一郎、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "腸球菌由来ヌクレオチド結合型V1-ATPaseのX線結晶構造解析"
    第84回日本生化学会大会　京都　2011年9月23日
  16. 橋本 直記、須藤 雄気、水谷 健二、森 永伍、今田 勝巳、本間 道夫、村田 武士
    "センサリーロドプシンI(SRI)の結晶構造解析"
    第84回日本生化学会大会　京都　2011年9月23日
  17. 山本 三沙岐、水谷 健二、山登 一郎、石塚 芳子、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "ヒトV型ATPaseの中央回転軸のX線結晶構造解析"
    日本生体エネルギー研究会 第37回討論会(ポスター発表)　京都　2011年12月21日
  18. 水谷 健二、山本 三沙岐、山登 一郎、柿沼 喜己、白水 美香子、John E. Walker、横山 茂之、岩田 想、村田 武士
    "DCCD結合型V-ATPaseローターリングの構造によって明らかになったNa+非結合状態のローターリング"
    日本生体エネルギー研究会 第37回討論会(ポスター発表)　京都　2011年12月21日
  19. 村田 武士、新井 聡史、西條 慎也、鈴木 花野、水谷 健二、柿沼 喜己、石塚 芳子、大沢 登、寺田 貴帆、白水 美香子、横山 茂之、岩田 想、山登 一郎
    "V1-ATPaseのX線結晶構造解析"
    日本生体エネルギー研究会 第37回討論会(口頭発表)　京都　2011年12月22日

Invited lectures

  1. 村田 武士
    "アデノシンA2a受容体と機能性抗体の共結晶構造"
    産総研セミナー(生命情報工学研究センター)　東京お台場　2011年4月22日
  2. 村田 武士
    "V1-ATPaseの結晶構造から見えてきた回転メカニズム"
    第11回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ　大阪　2011年6月９日
  3. 村田 武士、日野 智也、荒川 孝俊、岩成 宏子、小林 貴美、寿野 千代、名倉 淑子、新井 修、島村 達郎、野村 紀通、小林 拓也、浜窪 隆雄、岩田 想
    "機能性抗体によるGPCR不活性化の分子メカニズム"
    第84回日本生化学会大会 シンポジウム　京都　2011年9月24日

Press releases

  1. 「V型ATPaseの阻害機構の解明に成功 -骨粗鬆症やがんの新薬開発に繋がる成果-」
    2011年8月2日
  2. 「改造した質量分析装置を使って超分子膜タンパク質の構造情報を捉えた！」
    2011年10月21日
  3. 「タンパク質ナノモーターの回転軸の詳細構造を解明 −骨粗鬆症に関与する酵素の活性調節領域を同定−」
    2011年11月15日

Press release

  1. 「イオンと膜タンパク質 結合部分特定で新手法」
    『日刊工業新聞』　2011年2月21日

Introductory articles

  1. 「生体内で亜酸化窒素を生成する細菌由来の一酸化窒素還元酵素の立体構造」
    『サイエンス誌に載った日本人研究者』 p.77 (March 2011)
  2. 「Crystal Structure of the Rotor from V-ATPase Molecular Motor」
    PF Activity Report 2011 #29, 54-55 (2011). [pdf]